Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3CQ15386 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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UBE3CQ15386 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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