Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF4Q15306 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms