Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXF2Q12947 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms