Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2A2P52657 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A2P52657 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms