Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRXP46100 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRXP46100 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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