Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD1Q9BXT4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms