Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LYSTQ99698 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms