Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PKP4Q99569 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PKP4Q99569 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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