Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTDSPL2Q05D32 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms