Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMSP52788 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMSP52788 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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