Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms