Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4bP01029 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C4bP01029 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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C4bP01029 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C4bP01029 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C4bP01029 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C4bP01029 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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