Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA1C9JL84 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms