Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNX15Q9NRS6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms