Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rab5aQ9CQD1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rab5aQ9CQD1 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rab5aQ9CQD1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rab5aQ9CQD1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rab5aQ9CQD1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rab5aQ9CQD1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rab5aQ9CQD1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5aQ9CQD1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms