Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC27A3Q5K4L6 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC27A3Q5K4L6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms