Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Shcbp1lQ3TTP0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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