Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Traf3ip1Q149C2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms