Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP9BO43861 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms