Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF26H0Y7S4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms