Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms