Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ifna6P07350 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ifna6P07350 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ifna6P07350 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ifna6P07350 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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