Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATE1O95260 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ATE1O95260 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ATE1O95260 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ATE1O95260 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ATE1O95260 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ATE1O95260 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATE1O95260 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATE1O95260 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATE1O95260 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATE1O95260 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATE1O95260 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATE1O95260 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATE1O95260 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATE1O95260 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATE1O95260 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATE1O95260 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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