Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SNAPC1Q16533 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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SNAPC1Q16533 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SNAPC1Q16533 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SNAPC1Q16533 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SNAPC1Q16533 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SNAPC1Q16533 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SNAPC1Q16533 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SNAPC1Q16533 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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