Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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