Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BEX3Q00994 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms