Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP1S1P61966 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.6 ms