Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-FP30511 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms