Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC27P30260 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC27P30260 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms