Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmod4Q9JLH8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmod4Q9JLH8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmod4Q9JLH8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmod4Q9JLH8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmod4Q9JLH8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tmod4Q9JLH8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tmod4Q9JLH8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tmod4Q9JLH8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tmod4Q9JLH8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tmod4Q9JLH8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Tmod4Q9JLH8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmod4Q9JLH8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms