Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx32Q80ZJ7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms