Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A12Q504Y0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms