Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10378F6XQQ1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Gm10378F6XQQ1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Gm10378F6XQQ1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Gm10378F6XQQ1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Gm10378F6XQQ1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Gm10378F6XQQ1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Gm10378F6XQQ1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Gm10378F6XQQ1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Gm10378F6XQQ1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Gm10378F6XQQ1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Gm10378F6XQQ1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10378F6XQQ1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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