Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdr42e1Q9D665 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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