Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp1b4Q99ME6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms