Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Smim19Q80ZU4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Smim19Q80ZU4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Smim19Q80ZU4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Smim19Q80ZU4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Smim19Q80ZU4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Smim19Q80ZU4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Smim19Q80ZU4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Smim19Q80ZU4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim19Q80ZU4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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