Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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USP31Q70CQ4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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USP31Q70CQ4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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USP31Q70CQ4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP31Q70CQ4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP31Q70CQ4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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