Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms