Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV67

PPRC1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1Q5VV67 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPRC1Q5VV67 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPRC1Q5VV67 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms