Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LSP1P33241 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSP1P33241 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSP1P33241 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSP1P33241 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSP1P33241 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSP1P33241 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSP1P33241 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSP1P33241 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSP1P33241 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LSP1P33241 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LSP1P33241 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LSP1P33241 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms