Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APODP05090 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APODP05090 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APODP05090 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms