Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms