Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms