Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms