Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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