Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX7Q9UNH6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms