Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms