Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COG3Q96JB2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms