Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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EFNB3Q15768 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
EFNB3Q15768 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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