Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BACE1P56817 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BACE1P56817 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BACE1P56817 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms